Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8Q7

PDE12, 2',5'-phosphodiesterase 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE12Q6L8Q7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE12Q6L8Q7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDE12Q6L8Q7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms