Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDE2Q6IQ49 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDE2Q6IQ49 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms