Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP350Q5VT06 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP350Q5VT06 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms