Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TDRD12Q587J7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms