Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
LAMA3Q16787 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LAMA3Q16787 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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