Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC6Q16204 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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