Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZIC1Q15915 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZIC1Q15915 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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