Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NCAPHQ15003 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NCAPHQ15003 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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