Protein–RNA interactions for Protein: Q14781

CBX2, Chromobox protein homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX2Q14781 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CBX2Q14781 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms