Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DSC3Q14574 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DSC3Q14574 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms