Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM53BQ14153 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FAM53BQ14153 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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