Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD1Q13562 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD1Q13562 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
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