Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SRSF6Q13247 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SRSF6Q13247 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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