Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEMA3BQ13214 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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