Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GTF3C1Q12789 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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