Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SCAPQ12770 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCAPQ12770 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
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