Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCBP1Q09161 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms