Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GABPAQ06546 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABPAQ06546 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms