Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
IRF8Q02556 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
IRF8Q02556 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms