Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TNFRSF17Q02223 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TNFRSF17Q02223 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms