Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTUD4Q01804 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms