Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SPTBN1Q01082 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SPTBN1Q01082 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms