Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TFAMQ00059 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TFAMQ00059 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms