Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VLDLRP98155 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VLDLRP98155 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms