Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CTXN1P60606 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms