Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MCCD1P59942 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MCCD1P59942 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MCCD1P59942 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MCCD1P59942 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MCCD1P59942 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MCCD1P59942 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms