Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VEGFBP49765 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VEGFBP49765 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms