Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
THBS4P35443 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
THBS4P35443 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
THBS4P35443 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
THBS4P35443 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
THBS4P35443 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
THBS4P35443 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms