Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GJA4P35212 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GJA4P35212 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GJA4P35212 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms