Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDC27P30260 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDC27P30260 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDC27P30260 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDC27P30260 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms