Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTGFP29279 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CTGFP29279 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTGFP29279 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CTGFP29279 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTGFP29279 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTGFP29279 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms