Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPREP23469 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPREP23469 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPREP23469 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPREP23469 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPREP23469 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPREP23469 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms