Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PTPRDP23468 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms