Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPL17P18621 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPL17P18621 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPL17P18621 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPL17P18621 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms