Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC5A1P13866 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A1P13866 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms