Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ACTN1P12814 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ACTN1P12814 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms