Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAM228BP0C875 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms