Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MMP10P09238 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MMP10P09238 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MMP10P09238 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MMP10P09238 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MMP10P09238 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMP10P09238 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMP10P09238 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms