Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCB11O95342 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB11O95342 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms