Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNSO60931 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNSO60931 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNSO60931 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNSO60931 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNSO60931 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNSO60931 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNSO60931 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CTNSO60931 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTNSO60931 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTNSO60931 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms