Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CEP290O15078 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CEP290O15078 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CEP290O15078 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CEP290O15078 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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