Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF316A6NFI3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF316A6NFI3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms