Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF22A3QJZ6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF22A3QJZ6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms