Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPDC1A2A3K4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPDC1A2A3K4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms