Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

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Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 RPL31-202ENST00000409000 641 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC88CQ9P219 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC022558.1-201ENST00000560450 454 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC88CQ9P219 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC88CQ9P219 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC88CQ9P219 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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CCDC88CQ9P219 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CCDC88CQ9P219 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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CCDC88CQ9P219 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 RPL12P7-201ENST00000493832 494 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
CCDC88CQ9P219 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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