Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC027229.1-201ENST00000583887 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC092960.1-201ENST00000604762 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 BACH1-IT2-202ENST00000608072 691 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 Metazoa_SRP.189-201ENST00000614219 303 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 COMMD6-205ENST00000406936 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC091885.2-201ENST00000510391 1791 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 MAK-205ENST00000538030 2459 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 FGL1-203ENST00000398054 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL445238.1-204ENST00000400311 463 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL451061.1-201ENST00000407887 862 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC00687-201ENST00000427835 558 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-AS1-201ENST00000429832 1101 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC105393.2-201ENST00000431911 549 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL021707.2-201ENST00000431924 786 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ANXA2P2-201ENST00000435128 1020 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 GNA14-AS1-201ENST00000439145 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPS20P23-201ENST00000461683 354 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ANK3-213ENST00000486349 493 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC209005.1-201ENST00000514043 464 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 HMMR-AS1-201ENST00000514724 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC138123.2-204ENST00000547432 721 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RPL17P3-201ENST00000605695 525 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC012640.3-201ENST00000607847 430 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SMIM3Q9BZL3 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 PSMC1P4-201ENST00000515236 1327 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 RNA5SP382-201ENST00000363355 112 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 AC069213.1-202ENST00000417011 810 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 AC023141.1-201ENST00000419418 379 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 AL121983.2-201ENST00000426899 688 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SMIM3Q9BZL3 ARL17B-201ENST00000434041 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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