Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LZIC-203ENST00000400903 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 GTF2IP14-201ENST00000441415 586 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
ANKRD40Q6AI12 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms