Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SPRY3-201ENST00000302805 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL591848.4-201ENST00000567832 3472 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC131392.1-201ENST00000506490 633 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC007100.1-201ENST00000606382 478 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL592146.1-201ENST00000433869 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC108063.1-201ENST00000513586 414 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL161912.3-201ENST00000605404 628 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AC005393.1-201ENST00000617916 584 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
CCDC96Q2M329 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms