Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CASC18-202ENST00000548557 2503 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LRRC28-203ENST00000447360 1235 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC007991.4-201ENST00000522970 605 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP003080.1-202ENST00000526526 915 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 CLK4-214ENST00000611575 1206 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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RTL8BQ17RB0 AL356479.1-203ENST00000411798 1440 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AL020997.1-201ENST00000446554 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 LINC01364-201ENST00000452509 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RTL8BQ17RB0 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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