Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC091059.2-201ENST00000623355 614 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 SGO1-AS1-206ENST00000635369 442 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LUZP2-201ENST00000336930 3553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL353763.1-201ENST00000624467 1628 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 NALCN-202ENST00000376200 1126 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL589794.1-201ENST00000424971 390 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LHFPL3-AS1-204ENST00000433514 748 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC068408.1-201ENST00000577406 1144 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 TMCC1P1-201ENST00000518897 1980 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC245036.1-201ENST00000391727 309 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 MGST1-205ENST00000396210 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CUL4BQ13620 AC114752.1-201ENST00000448204 289 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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